В числе преимуществ биометрических систем перед традиционными СКУД, работающими с электронными RFID идентификаторами, явялется, во-первых высокая надежность этого способа идентификации, поскольку подделать какой-либо биометрический признак человека практически невозможно, и, во-вторых, невозможность делегирования полномочий на открытие другому лицу путём передачи RFID идентификатора. А это очень важно для корректного учета рабочего времени и допуска на особо важные объекты.
Биометрический считыватель с помощью сканера фиксирует уникальный биометрический признак пользователя, преобразует полученную информацию в цифровую модель. Эти данные соотносятся с базой, после чего принимается решение о допуске/недопуске пользователя в помещение. По способу сканирования биометрические сканеры делятся на устройства, осуществляющие идентификацию по отпечаткам пальцев, по форме кисти руки, по геометрии лица, а также по рисунку вен пальцев. Кроме того, биометрический считыватель может поддерживать распознавание карт и/или кодов, причем, эти методы идентификации могут использоваться в комбинации или по отдельности.
Универсальные биометрические считыватели могут работать как автономно, так и в составе централизованной сетевой СКУД.